第十二条 本实施办法施行前有下列情形之一的，矿业权人应按规定缴纳矿业权出让收益：
（一）对于无偿占有属于国家出资探明矿产地的探矿权和无偿取得的采矿权，应缴纳价款但尚未缴纳的，按协议出让方式征收矿业权出让收益。其中，探矿权出让收益在采矿权新立时征收；采矿权出让收益以2006年9月30日为剩余资源储量估算基准日（采矿权新立时间晚于2006年9月30日的，以采矿权设立时间为基准日）征收。
（二）已缴清价款或已完成有偿处置的探矿权，勘查区范围内变更或增列矿种的，在采矿权新立时比照协议出让方式征收新增矿种采矿权出让收益。
（三）已缴清价款的采矿权，矿区范围内新增资源储量和新增开采矿种的，比照协议出让方式征收新增资源储量、新增开采矿种 对应资源储量的采矿权出让收益。其中，仅涉及新增资源储量的采矿权出让收益，可在已缴纳价款对应的资源储量耗竭后征收。
（四）除本实施办法第十一条第一款第（四）项情形和以招标、拍卖、挂牌方式取得的采矿权外，历史上以其他方式取得采矿权的，不区分其勘查经费来源均以协议出让方式征收采矿权出让收益，采矿权出让收益以2006年9月30日（取得采矿权时间晚于该时点的，以采矿权设立时间）为剩余资源储量估算基准日征收。
（五）经矿产资源主管部门批准，按规定分期缴纳探矿权、采矿权价款的，在批准的分期缴款时间内，按矿业权出让合同或分期缴款批复缴纳剩余部分。分期缴纳的应按中国人民银行发布的同档次银行贷款基准利率承担资金占用费。
第十三条 国务院矿产资源主管部门登记的油气等重点矿种，按照国家相应规定征收矿业权出让收益。
第十四条 有下列情形之一的，矿产资源主管部门不征收矿业权出让收益：
（一）以申请在先方式取得探矿权后已转为采矿权且完成有偿处置的，但变更或增列矿种以及新增资源储量的除外。
（二）以招标、拍卖、挂牌、协议出让方式取得探矿权后已转为采矿权的，但变更或增列矿种以及新增资源储量的除外。
（三）已完成有偿处置的探矿权转采矿权的，但变更或增列矿种的除外。探矿权未转为采矿权，剩余的探矿权出让收益不再征收。
第十五条 本实施办法施行前经财政部门和矿产资源主管部门批准，已将探矿权、采矿权价款部分或全部转增国家资本金（国家基金），或以折股形式缴纳的，不再补缴探矿权、采矿权价款。
第十六条 探矿权未转为采矿权，探矿权人已缴纳的探矿权出让收益不再退还。
第十七条 矿业权（申请）人以出让金额形式缴纳矿业权出让收益的，低于规定额度的，应一次性缴纳，高于规定额度的，由矿业权（申请）人向矿产资源主管部门提交书面申请和分期缴款方案，经矿产资源主管部门对分期缴纳出让收益的期限、金额等进行审批批准（国务院矿产资源主管部门审批登记的由省级矿产资源主 管部门批准）后，可在采矿权有效期内分年度缴纳。
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